در راستای توسعه‌ فعالیت‌های شرکت، از سال ۱۳۹۷ این واحد اقدام به بارگیری و حمل مواد نفتی از مبادی پالایشگاه‌های اراک و کرمانشاه توسط راه‌آهن کرده تا ضمن کاهش هزینه‌های حمل، حجم بالایی از این مواد را در مدت زمان مناسب حمل کرده است.

با استفاده از مخازن و ناوگان ریلی، ظرفیت حمل شرکت به ماهانه بیش از ۲۰ هزار تن محموله‌های نفتی رسیده و برنامه‌ریزی افزایش حمل تا ۵۰ هزار تن در حال انجام است.شرکت پالایش نفت آفتاب در راستای افزایش توان و ظرفیت حمل‌ونقل خود، تأسیسات بارگیری واگن را در پالایشگاه کرمانشاه با کلیه‌ی امکانات از قبیل: ریل راه‌آهن، پمپ‌های مجهز بارگیری و ژنراتور جهت تأمین برق، تأسیس و راه‌اندازی کرده است.